Lançado em 25 de junho de 1999 para PlayStation no Japão, Metal Gear Solid: Integral é uma versão expandida do jogo original baseada na versão lançada para a América, substituindo as vozes originalmente japonesas com dublagem em inglês, enquanto que é oferecido escolher entre legendas em inglês ou japonês, o que aumenta ainda mais o conteúdo adicional, além de um disco extra de missões de treinamento de realidade virtual chamado "VR Disc". Adicionados no jogo principal estão uma roupa de infiltração alternativa para Meryl que complementa a adição do smoking de Snake e o estilo avermelhado do Ninja; uma nova dificuldade nomeada como "Very Easy" que traz uma nova arma: uma submetralhadora MP5 de munição infinita; uma frequência no Codec para se ouvir comentários do time de produção do jogo; um modo de visão em primeira pessoa; uma opção para rotas de patrulha alternativas para os inimigos e, por fim, um mini-jogo da PocketStation baixável.

O "VR Disc" traz mais de 300 missões que testam as habilidades de luta e infiltração do jogador, como também outros testes menos convencionais como mistérios de assassinato, batalhas contra soldados-genoma gigantes e três missões onde o jogador controla o Ciborgue Ninja. Conteúdo especial inclui trailers para Metal Gear Solid, um artwork prévio do Metal Gear RAY de Metal Gear Solid 2 e um modo de sessão fotográfica para tirar fotos de Mei Ling e Naomi. O "VR Disc" de Integral foi lançado como um produto separado fora do Japão — na América do Norte titulado como Metal Gear Solid: VR Missions (23 de outubro, 1999) e na Europa como Metal Gear Solid: Special Missions (29 de outubro, 1999). Se for colocado o disco de Special Missions, ao ser carregado, é dado uma mensagem ao jogador para trocar o disco por qualquer um dos discos de Metal Gear Solid. Se este último fosse corretamente identificado, o jogador pode recolocar o Special Missions e o jogo irá rodar normalmente. Este requisito estava ausente nas versões americana e japonesa do "VR Disc". Special Missions não pode ser jogado nos consoles de PlayStation 2 pré-SCPH-70000, já que ele não reconhecerá o disco de Metal Gear Solid; mas o jogo é compatível com outros consoles.

Uma conversão para PC do MGS: Integral também foi lançada para a Europa e América do Norte no fim do ano de 2000, com o suporte a PocketStation removido. Recebendo uma nota de 83/100 na mediação de matérias feita pela Metacritic, o jogo foi criticado por "erros de gráficos", a "natureza antiga" da conversão e, principalmente, por ter sido exatamente idêntico à versão para PlayStation.

Este game foi traduzido por -=Viper=- do grupo Made In Brasil (extinto). 

PS: O vídeo não corresponde à versão traduzida do jogo.